微生物發(fā)酵和細胞培養(yǎng)的目標產(chǎn)物主要有菌體、胞內(nèi)產(chǎn)物和胞外產(chǎn)物三類物質(zhì)。

從發(fā)酵液和細胞培養(yǎng)液中提取所需的生化物質(zhì)，第一步就需進行預(yù)處理，以便于固液分離，使代謝產(chǎn)物后續(xù)的分離純化工序順利進行。其原因有三個方面：首先，發(fā)酵液多為懸浮液，粘度大，為非牛頓型流體，不易過濾，而所需的生化物質(zhì)往往只有分布在液相，才能有效地提純。并且，在有些發(fā)酵液中，菌體自溶，核酸、蛋白質(zhì)及其他有機粘性物質(zhì)這三類物質(zhì)會造成濾液混濁、濾速極慢，必須設(shè)法增大懸浮物的顆粒直徑，提高沉降速度，以利于過濾；其次，目標產(chǎn)物在發(fā)酵液中的濃度通常較低；此外，發(fā)酵液的成分復(fù)雜，大量的菌絲體、菌種代謝物和剩余培養(yǎng)基會對提取造成很大的影響。所以，對發(fā)酵液進行適當?shù)念A(yù)處理，從而分離細胞、菌體和其他懸浮顆粒（如細胞碎片、核酸以及蛋白質(zhì)的沉淀物），并除去部分可溶性雜質(zhì)和改變發(fā)酵液的過濾性能，是生化物質(zhì)分離純化過程中必不可少的首要步驟。

   預(yù)處理方法要根據(jù)發(fā)酵產(chǎn)品、所用菌種和發(fā)酵液特性來選擇。大多數(shù)發(fā)酵產(chǎn)品存于發(fā)酵液中，少數(shù)存于菌體中，而發(fā)酵液和菌體中都有產(chǎn)物存在的情形也比較常見。如果目的產(chǎn)物是胞外產(chǎn)物，則通過離心或過濾實現(xiàn)固液分離，使其轉(zhuǎn)入液相；而對于胞內(nèi)產(chǎn)物而言，收集細胞是預(yù)處理的首要一步。細胞經(jīng)破碎或整體細胞萃取使目的產(chǎn)物釋放，轉(zhuǎn)入液相，再進行細胞碎片的分離。如果所需的產(chǎn)物為細胞，離心或過濾所得固相經(jīng)干燥等過程就可得到菌體。